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Aporte de la biología molecular en el diagnóstico
de infecciones respiratorias agudas
Isolda Budnik O.*, Marcela Ferrés G.*
,
**
,
***, Trinidad Pardo T.*, Javiera Edwards T.**,
Gonzalo Labarca T.**, Felipe Reyes Z.**, Constanza Martinez-Valdebenito***,
Luisa Montecinos P.*** y Cecilia Perret P.*
Contribution of multiplex respiratory molecular panel to the diagnosis of acute respiratory
infections
Objective
: To assess the performance of multiplex-PCR for diagnosis of respiratory viruses in
parallel with direct fluorescence assay (DFA). We assessed the performance and co-infection diagnosis
of molecular respiratory panel PCR (MRP-PCR) and DFA in hospitalized and outpatients.
Results:
8535 samples were included, 1792 tested by MRP-PCR (46.9% positive) and 6743 by DFA (35.1%
positive). MRP-PCR diagnosed co-infection in 21.3% and DFA in 1.8% of the samples. Rhinovirus
was the most common virus in any age group. In 210 patients both tests were done; 100 were positive
by MRP-PCR and 18 by DFA. Positive concordance value was 6.2%. 85 samples were positive only by
MRP-PCR and in 42 of them only novel respiratory viruses were identified. Performance of MRP-PCR
was statistically significant compared DFA for traditional respiratory viruses.
Discussion:
Multiplex
PCR has shown better sensitivity, may expand the etiologic spectrum of respiratory infections and detect
a higher number of co-infections.
Key words
: Respiratory Tract Infections; Viruses; Rhinovirus ; Fluorescence; Multiplex Polime-
rase Chain Reaction.
Resumen
Objetivo
: Evaluar la contribución del panel respiratorio molecular por reacción en cadena de la
polimerasa-multiplex (PRM-RPC) en paralelo a la de inmunofluorescencia directa (IFD) al diagnóstico
de infecciones respiratorias. Analizamos y comparamos el rendimiento y diagnóstico de co-infección
de PRM-RPC con IFD en pacientes hospitalizados y ambulatorios.
Resultados:
Se analizaron 8535
muestras; 1792 por PRM-RPC (46,9% positivas) y 6743 por IFD (35,1% positivas). La co-infección fue
21,3% por PRM-RCP y 1,8% por IFD. El virus más frecuente fue rinovirus a toda edad. Se analizaron
210 pacientes por ambos métodos; resultaron positivas 100 por PRM-RPC y 18 por IFD, concordancia
positiva de 6,2%. 85 muestras fueron solo positivas por PRM-RPC, 42 diagnosticaron nuevos virus
respiratorios. El rendimiento de PRM-RPC fue significativamente mayor que el de IFD para virus
respiratorios tradicionalmente diagnosticados.
Conclusiones
: La RCP-multiplex tiene mejor sensibi-
lidad, podría expandir el espectro etiológico de infecciones respiratorias y detectar un mayor número
de co-infecciones comparado a IFD.
Palabras clave
: Infecciones Respiratorias; Virus; Rinovirus; Fluorescencia; Reacción en Cadena
de la Polimerasa-Multiplex.
Fuente de nanciamiento: ninguna.
* Escuela de Medicina, División de Pediatría, Pontificia Universidad Católica de Chile.
** Escuela de Medicina, Pontificia Universidad Católica de Chile.
***Laboratorio de Infectología y Virología Molecular. Pontificia Universidad Católica de Chile.
Rev Chil Enferm Respir 2016; 32: 224-232
trabajo original
Abreviaturas:
VRS: Virus respiratorio sincicial; ADV: adenovirus ; MPV: metapneumovirus; FLU A y FLU B influenza A y B;
VPI: parainfluenza 1, 2, 3, 4; RN: rinovirus; BoV: bocavirus; coronavirus Co OC43: OC43 y CoNL63: 229E/NL63
y EV: enterovirus.